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根据去年播出的「时间飞船24」世界观改编，以三恶人为主人公的时间飞船系列作品。三恶人是指本作中的坏蛋三人组，平常的掩饰身份为世界最大的教科书出版社“历史天国社”第14仓库课的成员，分别是毕玛乔（喜多村英梨）、兹夫亚基（平田广明）和铃木（三宅健太）。

猫国王会聚集全国的猫举行的集会。猫国王叫做猫妖精，是胸前有白斑，体型像牛一般大的黑猫。亚利亚和姬都有参加这个聚会。举行集会的地方是火星还没有被称为AQUA（水星）的时候就存在的厂房的废墟。

生活在诹访原市的极其普通的学生藤井莲，和亲友游佐司狼互殴决斗后，绝交。其后仍然与青梅竹马绫濑香纯和学姐冰室玲爱一起过着学园生活。但他所居住的诹访原市开始出现无差别断头杀人事件。并且奇怪的是，莲这时开始做起自己在断头台上被斩首的噩梦。而这对他来说，只是充满恐惧和痛苦的战争的前兆。日常生活被颠覆。暗处超常人群在暗暗行动。城市成为战场，超乎寻常的事情向莲袭来。面对不战斗就无法生存的现实，他是否能夺回自己平凡的生活呢？