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前美军特种部队炸弹专家史蒂芬·阿瑟·杨格正走向一条危险之途，作为穆斯林他不满美国对待阿拉伯国家的政策，于是策划发动恐怖袭击。他宣称在三个城市中分别安放了三颗小型原子弹，美国本土危在旦夕。FBI反恐部门女探员海伦·布洛迪负责调查此案，却在紧要关头发现军方以及一个神秘部门介入其中。她的小队连同极度危险的谈判专家亨利·汉弗莱斯受命审讯史蒂芬。

一直想寻根的超人（布兰登·罗斯 饰）返回了氪星，希望可以找到其他同伴，但那里的一切早已不复存在。而这一去便是五年。五年后，超人回到了地球，但是周遭的一切已经改变。他发现地球已经习惯了没有超人的保护，他一直爱慕的露易丝因为馔写了一篇“为什么世界不需要超人”的报道而获得普利策大奖。另一边，他的死对头莱克斯利用卑鄙手段骗取了巨额遗产，企图卷土重来。超人能否战胜心魔，再一次挽救地球于水火？